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2006年夏の高校野球長崎大会の結果

2006年の夏の高校野球長崎大会は、清峰が2年連続2回目の優勝を飾った大会である。決勝は2-0の接戦の末、波佐見を退けた。ベスト4には長崎南山、瓊浦が入った。

優勝校・上位進出校

優勝	清峰 (決勝 2-0)
準優勝	波佐見
ベスト4	長崎南山、瓊浦
ベスト8	佐世保北、創成館、西陵、長崎日大

決勝

勝者	スコア	敗者
清峰	2 - 0	波佐見

準決勝

勝者	スコア	敗者
清峰	15 - 5	長崎南山
波佐見	9 - 1	瓊浦

準々決勝

勝者	スコア	敗者
清峰	6 - 1	佐世保北
長崎南山	9 - 8	創成館
波佐見	7 - 5	西陵
瓊浦	6 - 5	長崎日大